Fundado em 1999, o IMDH nasceu e tem marcada em sua história a dedicação integral à assistência jurídica e humanitária e à promoção da integração laboral e sociocultural dos migrantes, refugiados e apátridas. Colabora para incluí-los em políticas públicas e atua na demanda e incidência por políticas específicas em favor desta população. Dedica, ainda, atenção prioritária a mulheres, crianças e pessoas em situações de maior vulnerabilidade.

O Instituto Migrações e Direitos Humanos (IMDH) tem sede em Brasília e, desde 2018, em atenção à crise humanitária da Venezuela, conta com um escritório em Boa Vista (Roraima). É vinculado à Fundação Scalabriniana, sediada em Roma, e tem a finalidade de promover a acolhida, a proteção e a integração de migrantes, refugiados, refugiadas e apátridas.